Così come usi il serial monitor di Arduino, puoi usare hyperterminal, putty o qualsiasi altro programma, oppure un qualsiasi linguaggio che acceda alle porte seriali, ad esempio C# con la classe SerialPort. Naturalmente devi usare la stessa COM virtuale che viene assegnata quando connetti il dispositivo al PC e la stessa baud rate. Lato processore devi ovviamente implementare sia RX che TX della UART, se vuoi un'interfaccia completa