LaTeX va studiato!
Ed e' anche un po' ostico .
Perche' spesso oltre a LaTeX ti tocca studiare anche TeX e un sacco di packages.
In questo caso non dovrebbe essere difficile risolvere il problema.
Dovresti andare alla riga indicata dai warning e vedere che cosa c'e' scritto.
Per il reference, dovrebbe bastare commentare il comando, per il font, commentare il comando o installare il font richiesto.
Di piu', senza sapere quale distribuzione stai utilizzando e il il contenuto del file .tex, non e' possibile fare.