Ti da problemi la query?
Prova un po' così:
$toinsert = "UPDATE ordine SET conf_ord='".$conf_ord."' WHERE id=".$id;
Ti faccio delle osservazioni poi vedi tu:
1. controlla se il valore è un numero intero, una confezione è 1 e non 1,2 o 1.5.
2. se per esempio l'utente inserisce "2,3" non è intero tu avvii lo script in php fai il controllo vedi che il valore è errato blocchi lo script perché il valore inserito non è intero. Devi tornare indietro alla pagina dove hai la lista.
Ti dico la mia poi vedi tu...
Utilizzerei ajax con delle librerie/framework jquery o vue o react ecc... in più metterei il controllo dei valori inseriti anche in js, lato client oltre lato server.
Ciao