Dipende cosa ti serve.
Puoi salvarli come variabili in un file .mat (è un'estensione di matlab). Nel momento in cui lo apri le variabili salvate vengono caricate nel workspace in modo da poter continuare ad usarle in matlab.
Oppure potresti voler salvare i risultati in un file di testo, oppure potresti voler salvare i risultati sottoforma di grafici.
In genere i risultati non si salvano spesso, perché in un secondo rilanci il codice e hai tutti i valori che ti servono per continuare a lavorare.
Dipende da quello che vuoi fare.