Ciao.
Allora:
1) usare il comando "min" per questo problema in generale è sbagliato, nel senso che se avessi numeri negativi, non ritornerebbe la posizione degli zeri.
Puoi usare questi comandi:
index = find(v == 0); % ritorna gli indici in cui il tuo vettore vale zero
v(index) % restituisce il vettore di soli zeri che hai selezionato
2) Non conosco un comando specifico per fare quello che cerchi.
Però in generale, anzichè trovare la riga di zeri ed eliminarla subito (che ti riduce di volta in volta le dimensioni della matrice di partenza), potresti semplicemente scorrere completamente la matrice, individuare quali righe hanno tutti 0, e infine selezionare la matrice le righe della matrice iniziale, escludendo le righe che hai trovato precedentemente.
Spero ti sia di aiuto l'algoritmo. Se ti serve anche il codice fammi sapere
Ciao