No, non è possibile a meno che tu non voglia sperimentare soluzioni "estreme" che probabilmente non si adatterebbero al codice che hai già scritto.
https://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/437967-is-there-a-way-to-start-indexing-with-0-in-matlab
La cosa più pratica da fare è rivedere l'impostazione del tuo codice in modo da eliminare la necessità di avere gli indici che partono da 0.
In teoria non dovrebbe essere difficile, ma dal momento che non hai pubblicato il codice (o almeno la parte rilevante) non si può dire molto di più