Ciao,
per prima cosa php e' un linguaggio di scripting lato server, vuol dire che le istruzioni vengono eseguite sul server e poi inviate al client sottoforma di html.
Javascript, e' un linguaggio di scripting lato client. Gira sulla macchina dell'utente.
Un idea, anche se poco elegante, sarebbe quella di inserire l'output della funzione php in campi hidden poi, la funzione javascript, legge il contenuto di questi campi.