Ciao Alaskana,
non sono a conoscenza di altri algoritmi già affermati, ti dico solo quello che mi viene in mente di primo acchito:
Se consideri le facce di un grafo (in un disegno planare chiaramente), puoi considerare le facce create da 3 nodi (e via via aumentando) e verificare se esistono esistono corrispondenze negli altri grafi. Fatto ciò puoi cominciare a creare sottografi (formati da facce adiacenti) e verificare ancora una volta se ci sono corrispondenze.