Grazie per il tuo aiuto, problema risolto ma non avevo dubbi.
Ho impostato le variabili di ambiente e generato il jar corretto.
Il problema era sull'IDE.
Ho ricreato il progetto su IntelliJ e ho risolto anche sull'IDE.
Restavano gli avvisi rossi ma i file venivano regolarmente inclusi.
Ho provato ad aggiungere:
<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
<artifactId>maven-jar-plugin</artifactId>
<version>3.2.2</version>
e ho risolto tutto anche sull'IDE.
La domanda però è questa: devo definire la versione del plugin oppure no? Non è Maven che dovrebbe sceglierla in automatico? Insomma, per tagliar corto, non sono convinto di aver fatto cosa buona e giusta.