Provo a spiegarmi meglio.
Nel progetto A ho il file log4j.properties che funziona correttamente con le classi del progetto. Quando però istanzio una classe del progetto B (presente in un jar lincato tramite il classpath), mi aspetto che le impostazioni di log4j siano ancora quelle del progetto A anche per le classi di B, invece non è così e non trovo messaggi nei file di log