Ciao digitalweb,
In realtà è da parecchio tempo che non mi occupo di Angular (diciamo da quando si chiamava ancora AngularJS). Comunque, in genere i framework funzionano utilizzando una pagina base (nel tuo caso è probabilmente quella che trovi in src/index.html). Se lo aggiungi lì dovrebbe funzionare.
In alternativa, su
questa domanda di StackOverflow, vedo che consigliano di salvare il codice in un file javascript e includerlo nel file .angular-cli.json, alla voce "apps" -> "scripts" (guarda il link per saperne di più)
Spero di esserti stato utile